CABRI est une organisation internationale administrée par trois instances principales, à savoir, l’Assemblée générale (AG), le Comité directeur (CD) et le Secrétariat. CABRI a été créée par un Accord international.
L’Assemblée générale qui est l’autorité suprême de prise de décision. Elle se compose de tous les États membres de CABRI et se réunit une fois par an pour ratifier le plan de travail et le budget de CABRI, adopter les comptes audités et fournir l’orientation politique globale.
Le Comité directeur est nommé par l’Assemblée générale pour un mandat de deux ans et comprend sept membres. Cinq membres sont nommés par l’Assemblée. La Secrétaire exécutive et le Président de l’Assemblée générale sont des membres d’office du Comité directeur. Ses responsabilités principales consistent à fournir des directives stratégiques, à assurer la supervision et le contrôle ainsi qu’à effectuer le suivi de la mise en œuvre du plan de travail et du budget annuels du Secrétariat. Le Comité directeur se réunit quatre fois par an. Ses membres actuels sont l'île Maurice, le Rwanda, le Kenya, le Ghana et La Gambie.
Le Secrétariat met en œuvre le plan stratégique triennal de CABRI ainsi que le plan de travail et le budget annuel. Le Secrétariat soutient également l'Assemblée générale et le Comité directeur pour qu’ils exercent leurs fonctions. Le Secrétariat qui est basé en Afrique du Sud est dirigé par la Secrétaire exécutive de CABRI.